Grupo de cooperación COVID-19

Nuestro objetivo

Este repositorio obtiene, clasifica y presenta el conocimiento disponible en relación con la COVID-19 para dar respuesta a la necesidad de información actualizada en temas prioritarios durante la pandemia. Este proyecto es una iniciativa colaborativa de profesionales de diversas áreas del conocimiento sin conflictos de interés.

Usuarios potenciales

Teniendo en cuenta los documentos compilados y el proceso que se lleva a cabo para su clasificación, traducción al español e interligado, los usuarios potenciales de este repositorio son:

1. Personal sanitario
2. Tomadores de decisiones
3. Investigadores biomédicos
4. Lingüistas computacionales
5. Traductores

Antecedentes

La enfermedad por el Coronavirus 2019 (COVID-19) es una infección causada por el Coronavirus 2 del Síndrome Agudo Severo Respiratorio (SARS-CoV-2, por sus siglas en inglés). El virus SARS-CoV-2 pertenece a la misma familia de los coronavirus que causan el Síndrome Respiratorio del Este Medio (MERS-CoV, por sus siglas en inglés) y el Síndrome Respiratorio Severo Agudo (SARS-CoV)¹. La COVID-19 fue declarada pandemia el 11 de marzo de 2020 por la Organización Mundial de la Salud.

Debido a la alta producción de documentos relacionados con esta enfermedad y viendo la necesidad de clasificar dicha información de acuerdo con criterios clínicos, cuatro profesionales crearon un repositorio de acceso libre. Las fuentes de información que se han tomado en cuenta para este proyecto son bases de datos médicas, páginas web gubernamentales e institucionales.

El repositorio clínico es producto de una colaboración iniciada a través del contacto de Alejandra López (estudiante de doctorado de la Universidad Pompeu Fabra) con la Dr. Mónica Ballesteros y el Dr. Johannes Graën en conjunto con el grupo de investigación de los doctores Julio Collado y Carlos Francisco Méndez del Centro de Ciencias Genómicas en la UNAM, México, así como el Dr. Oscar Lithgow y posteriormente el Dr. Fabio Rinaldi, lingüista computacional del laboratorio Suizo de Inteligencia Artificial IDSIA.

Metodología

1. Búsqueda de la literatura

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2. Criterios de elegibilidad de los documentos

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3. Clasificación

La clasificación de los artículos y documentos se realizó teniendo en cuenta el esquema PRECEPT. Los documentos se han clasificado en: especialidades clínicas, tipos, tópicos y subtópicos

Categorías de documentos en el repositorio clínico

Especialidades clínicas

Esta categoría presenta los documentos clasificados dentro de 28 especialidades clínicas (cardiología, neumología, etc.).

Tipos

• Estudios de intervención:

Un estudio de intervención es aquel en el que se realiza algún tipo de intervención en los participantes (por ejemplo, la administración de un fármaco), con el objetivo de evaluarla. En esta carpeta se incluyen ensayos clínicos controlados randomizados, estudios no randomizados con control.

• Estudios observacionales:

Los estudios observacionales corresponden a diseños de investigación cuyo objetivo es "la observación y registro" de acontecimientos sin intervenir en el curso natural de estos. Las mediciones, se pueden realizar a lo largo del tiempo (estudio longitudinal), ya sea de forma prospectiva o retrospectiva; o de forma única (estudio transversal).

• Revisión narrativa:

Recopilación de la bibliografía sobre un tema determinado

• Revisión sistemática:

Una revisión sistemática tiene como objetivo reunir toda la evidencia empírica que cumple unos criterios de elegibilidad previamente establecidos, con el fin de responder una pregunta específica de investigación. Utiliza métodos sistemáticos y explícitos, que se eligen con el fin de minimizar sesgos, aportando así resultados más fiables a partir de los cuales se puedan extraer conclusiones y tomar decisiones (Antman 1992, Oxman 1993).

• Guías de Práctica clínica:

Las guías de práctica clínica proporcionan recomendaciones sobre los beneficios y desventajas de diferentes intervenciones disponibles en la asistencia sanitaria.

• Otros:

Documentos que no pueden ser clasificados en ninguna de las categorías anteriores.




Tópicos y subtópicos

La carpeta tópicos contiene las siguientes subcarpetas, de acuerdo con la clasificación del "living evidence map on COVID-19"³:

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• Diagnóstico:

Documentos relacionados con las pruebas de detección del COVID-19 basadas en PCR y RT-PCR, pruebas serológicas, diagnóstico clínico (por historia clínica, por imágenes, pruebas sanguíneas).

• Pronóstico:

Documentos que determinen el pronóstico de la enfermedad COVID-19 por criterios clínicos o de laboratorio. Así como, estudios que determinen la tasa de letalidad, de complicaciones o de discapacidad.

• Epidemiología:

Documentos relacionados con la incidencia y prevalencia de la enfermedad COVID-19.

• Etiología:

Documentos o artículos relacionados con: las características del SARS-CoV-2 (el origen o historia del SARS-CoV-2, análisis de las secuencias, subtipos, serotipos del SARS-CoV-2, patogenicidad y virulencia, reservorios); modos de transmisión (animal a persona, persona a persona, aerosoles, sangre, heces fecales, superficies); patofisiología (periodo de incubación, respuesta inmune del SARS-CoV-2).

• Experiencias, percepciones, concepciones:

Documentos relacionados con percepciones, confiabilidad, barreras y facilitadores, aspectos políticos, aspectos económicos, aspectos éticos, consecuencias colaterales, medios de comunicación social, equidad.

• Generalidades clínicas:

Documentos de cohortes que describen características clínicas.

• Intervenciones:

Documentos de intervenciones que tengan por objetivo manejar la pandemia: estrategias para modificación de comportamientos, identificación de casos, seguimiento a contactos, estrategias de comunicación, desinfección de espacios públicos, almacenes y oficinas, sistemas de información geográfica, planeación para incrementar camas en UCI, triage y planeación del personal.

• Modelización:

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• Prevención y control:

Documentos relacionados con la cuarentena, restricciones de circulación de los ciudadanos, aislamiento, restricciones de colegios, jardines infantiles, trabajo desde casa, restricciones de actividades de negocios y eventos, restricciones de viaje, barreras físicas (mascaras, guantes, otros), lavado de manos, desinfección de manos, vacunas.

• Servicios de salud:

Documentos relacionados con la investigación de los servicios de salud.

En cuanto a los subtópicos, existen 27 diferentes categorías, tales como aislamiento, diagnóstico clínico, pruebas serológicas, vacunas, entre otras. Al seleccionar uno de estos subtemas, el sistema mostrará automáticamente los documentos que pertenecen al subtema elegido, así como información sobre cuál es el tema principal. Para acceder al repositorio haga click aquí